白皙嫩滑的手臂被抓得生疼的樱桃忍着手臂上的疼痛，不由得为陈源担心起来，且不说他是她心目中的好人，单是如今离了地下城，她还需要靠他生活呢，如果他这个时候出了什么事，她一个没甚见识，又没甚手艺的女人在这样一个从来没有来过的世界，如何能够生存下去？2044年的纽约，大反派朗格勾结外星恶势力试图毁灭地球，大量外星人通过神秘传送门入侵，将城市化为灰烬。忍者神龟们虽负隅顽抗仍不敌敌人攻势，死伤惨重。怀抱着忍者最强武器——希望，忍者神龟们决定回到过去时空，找到开启传送门的钥匙，阻止朗格，恢复世界和平。李奥纳多的弟子凯西肩负起这一使命，他在过去时空与女记者艾普利尔·奥尼尔成功接头，并和忍者神龟李奥纳多、米开朗基罗、拉斐尔、多纳太罗汇合，开启了拯救世界的行动。“我们的未来，我们自己做主”忍者神龟们向朗格发起了终极挑战。
